重庆医院建设医疗卫生提质项目总投资35000万元，中央预算内投资3500万元占比10%。如县级医院提标扩能、疾控中心建设等。项目资金筹措方案经过反复优化，最终形成了中央投资、地方配套和自筹资金三位一体的资金保障体系。
在中央预算内投资3500万元的具体分配上，医院建设建设投资占2450万元，医院建设设备购置占700万元，其他费用占350万元。省级配套资金按1:0.5的比例安排，市县财政和项目自筹资金按1:1的比例配套。
项目资金筹措采取中央、省、市县和项目单位四方共担机制。重庆积极协调省级配套资金，重庆将市县配套纳入财政预算优先保障。如县级医院提标扩能、疾控中心建设等，资金到位率在医疗卫生提质专项中位居前列。
