浙江温州水环境治理重点流域水环境治理项目总投资60000万元，其中申请中央预算内投资6000万元，占总投资的10%。项目资金来源包括中央预算内投资、省级配套资金、市县财政资金和项目单位自筹资金四个渠道。如长江大保护水环境治理、黄河流域生态修复等，该项目的投资结构具有较强的代表性。
6000万元中央投资的资金分配经过多轮优化：水环境治理主体工程3900万元，配套水环境治理设施1200万元，前期费用和预备费900万元。省级和市县配套资金的到位情况良好，项目整体资金保障充足。
为确保资金按时到位，浙江温州建立了专项资金管理台账，对6000万元中央预算内投资实行专账管理。地方配套资金纳入年度财政预算，项目自筹资金通过银行贷款和企业自有资金解决。如长江大保护水环境治理、黄河流域生态修复等
