重庆区域发展重大区域战略建设项目总投资60000万元，其中申请中央预算内投资6000万元，占总投资的10%。项目资金来源包括中央预算内投资、省级配套资金、市县财政资金和项目单位自筹资金四个渠道。如京津冀交通一体化、长三角生态共保联治等，该项目的投资结构具有较强的代表性。
在中央预算内投资6000万元的具体分配上，区域发展建设投资占4200万元，区域发展设备购置占1200万元，其他费用占600万元。省级配套资金按1:0.5的比例安排，市县财政和项目自筹资金按1:1的比例配套。
项目资金筹措采取中央、省、市县和项目单位四方共担机制。重庆积极协调省级配套资金，重庆将市县配套纳入财政预算优先保障。如京津冀交通一体化、长三角生态共保联治等，资金到位率在重大区域战略建设专项中位居前列。
